MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 plasmid p5482

Total Repeats: 616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004703	ATT	2	6	25	30	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29611501
2	NC_004703	TGT	2	6	33	38	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29611501
3	NC_004703	CGA	2	6	66	71	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611501
4	NC_004703	TTTC	2	8	159	166	0 %	75 %	0 %	25 %	29611501
5	NC_004703	GACG	2	8	180	187	25 %	0 %	50 %	25 %	29611501
6	NC_004703	TTG	2	6	266	271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29611501
7	NC_004703	GTC	2	6	277	282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611501
8	NC_004703	GAAA	2	8	287	294	75 %	0 %	25 %	0 %	29611501
9	NC_004703	AAT	3	9	352	360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29611501
10	NC_004703	GGA	2	6	477	482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611501
11	NC_004703	GAT	2	6	524	529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611501
12	NC_004703	A	6	6	633	638	100 %	0 %	0 %	0 %	29611502
13	NC_004703	CCA	2	6	691	696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29611502
14	NC_004703	GGA	2	6	842	847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611502
15	NC_004703	CAGCCG	2	12	873	884	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	29611502
16	NC_004703	GAT	2	6	962	967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611502
17	NC_004703	ATC	2	6	975	980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29611502
18	NC_004703	CGTTT	2	10	993	1002	0 %	60 %	20 %	20 %	29611502
19	NC_004703	TAC	2	6	1005	1010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_004703	CTA	2	6	1013	1018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_004703	TAG	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004703	TAC	2	6	1030	1035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_004703	CTT	2	6	1121	1126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29611503
24	NC_004703	ATG	2	6	1156	1161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611503
25	NC_004703	TTCAT	2	10	1177	1186	20 %	60 %	0 %	20 %	29611503
26	NC_004703	GAC	2	6	1227	1232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611503
27	NC_004703	GTC	2	6	1242	1247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611503
28	NC_004703	GGA	2	6	1292	1297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611503
29	NC_004703	GAT	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611503
30	NC_004703	GTA	2	6	1428	1433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611503
31	NC_004703	TTC	2	6	1524	1529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_004703	A	7	7	1541	1547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004703	TC	3	6	1548	1553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_004703	AAT	2	6	1555	1560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004703	T	7	7	1578	1584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004703	AGT	2	6	1624	1629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004703	AACGT	2	10	1640	1649	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_004703	ACG	2	6	1791	1796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611504
39	NC_004703	GAC	2	6	1815	1820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611504
40	NC_004703	ACG	2	6	1837	1842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611504
41	NC_004703	CGC	2	6	1913	1918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29611504
42	NC_004703	A	7	7	1945	1951	100 %	0 %	0 %	0 %	29611504
43	NC_004703	AGG	2	6	2047	2052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611504
44	NC_004703	GAT	2	6	2105	2110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611504
45	NC_004703	GGGA	2	8	2192	2199	25 %	0 %	75 %	0 %	29611504
46	NC_004703	GGA	2	6	2231	2236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611504
47	NC_004703	GGC	2	6	2273	2278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29611504
48	NC_004703	TACC	2	8	2281	2288	25 %	25 %	0 %	50 %	29611504
49	NC_004703	GAA	2	6	2328	2333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29611504
50	NC_004703	GAA	2	6	2375	2380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29611504
51	NC_004703	CCG	2	6	2509	2514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_004703	TAT	2	6	2585	2590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004703	GACG	2	8	2696	2703	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_004703	ACC	2	6	2707	2712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_004703	CA	3	6	2720	2725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_004703	TCTT	2	8	2766	2773	0 %	75 %	0 %	25 %	29611505
57	NC_004703	GCA	2	6	2806	2811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611505
58	NC_004703	TCG	2	6	2868	2873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611505
59	NC_004703	ACGA	2	8	2991	2998	50 %	0 %	25 %	25 %	29611505
60	NC_004703	TTG	3	9	3002	3010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29611505
61	NC_004703	AGG	2	6	3199	3204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611505
62	NC_004703	TCGA	2	8	3234	3241	25 %	25 %	25 %	25 %	29611505
63	NC_004703	TAA	2	6	3243	3248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29611505
64	NC_004703	TTC	2	6	3327	3332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29611505
65	NC_004703	CCG	2	6	3345	3350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29611505
66	NC_004703	GTA	2	6	3362	3367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611505
67	NC_004703	TGT	2	6	3427	3432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29611505
68	NC_004703	CGT	2	6	3437	3442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611505
69	NC_004703	CAC	2	6	3446	3451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29611505
70	NC_004703	TGG	2	6	3471	3476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29611505
71	NC_004703	CAT	2	6	3515	3520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29611505
72	NC_004703	TTG	2	6	3549	3554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29611505
73	NC_004703	TTC	2	6	3555	3560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29611505
74	NC_004703	C	6	6	3560	3565	0 %	0 %	0 %	100 %	29611505
75	NC_004703	TCG	2	6	3570	3575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611505
76	NC_004703	CGA	2	6	3586	3591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611505
77	NC_004703	GTT	2	6	3619	3624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29611505
78	NC_004703	AGG	2	6	3669	3674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611505
79	NC_004703	CTT	2	6	3739	3744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29611505
80	NC_004703	AGG	2	6	3752	3757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611505
81	NC_004703	T	10	10	3792	3801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004703	A	6	6	3840	3845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004703	TATT	2	8	3884	3891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004703	A	6	6	4007	4012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004703	AAG	2	6	4053	4058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004703	A	6	6	4135	4140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004703	CG	3	6	4172	4177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_004703	TTTTGT	2	12	4193	4204	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004703	GCC	2	6	4235	4240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_004703	T	6	6	4258	4263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004703	G	6	6	4264	4269	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004703	CGA	2	6	4349	4354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_004703	GA	5	10	4365	4374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004703	ACG	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_004703	AGCA	2	8	4394	4401	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_004703	AT	3	6	4442	4447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004703	TATG	2	8	4465	4472	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004703	CATA	2	8	4480	4487	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_004703	ATT	2	6	4496	4501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004703	TATG	2	8	4542	4549	25 %	50 %	25 %	0 %	29611506
101	NC_004703	CAA	3	9	4575	4583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29611506
102	NC_004703	AAC	2	6	4693	4698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29611506
103	NC_004703	GCC	2	6	4726	4731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29611506
104	NC_004703	AAC	2	6	4821	4826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29611506
105	NC_004703	AT	3	6	4879	4884	50 %	50 %	0 %	0 %	29611506
106	NC_004703	CGA	2	6	5062	5067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611506
107	NC_004703	GAA	2	6	5071	5076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29611506
108	NC_004703	GGGA	2	8	5263	5270	25 %	0 %	75 %	0 %	29611507
109	NC_004703	T	6	6	5276	5281	0 %	100 %	0 %	0 %	29611507
110	NC_004703	ACG	2	6	5359	5364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611507
111	NC_004703	TTC	2	6	5370	5375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29611507
112	NC_004703	A	6	6	5463	5468	100 %	0 %	0 %	0 %	29611507
113	NC_004703	ATC	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29611507
114	NC_004703	CGG	2	6	5950	5955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29611507
115	NC_004703	TCG	2	6	5965	5970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611507
116	NC_004703	AAGG	2	8	6005	6012	50 %	0 %	50 %	0 %	29611507
117	NC_004703	AAC	2	6	6079	6084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29611507
118	NC_004703	AGC	2	6	6097	6102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611507
119	NC_004703	CCGG	2	8	6150	6157	0 %	0 %	50 %	50 %	29611507
120	NC_004703	ATG	2	6	6268	6273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611507
121	NC_004703	ACG	2	6	6285	6290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611507
122	NC_004703	GAA	2	6	6374	6379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29611507
123	NC_004703	A	6	6	6546	6551	100 %	0 %	0 %	0 %	29611507
124	NC_004703	GCC	2	6	6574	6579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29611507
125	NC_004703	GTACAA	2	12	6611	6622	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	29611507
126	NC_004703	AGG	2	6	6625	6630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611507
127	NC_004703	TTTC	2	8	6670	6677	0 %	75 %	0 %	25 %	29611507
128	NC_004703	AGG	2	6	6745	6750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611507
129	NC_004703	GCA	2	6	6755	6760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611507
130	NC_004703	CAG	2	6	6765	6770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611507
131	NC_004703	GAA	2	6	6798	6803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29611507
132	NC_004703	ATG	2	6	6880	6885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611507
133	NC_004703	TTCT	2	8	7133	7140	0 %	75 %	0 %	25 %	29611507
134	NC_004703	TTGC	2	8	7158	7165	0 %	50 %	25 %	25 %	29611507
135	NC_004703	GGT	2	6	7245	7250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29611507
136	NC_004703	CAAA	2	8	7256	7263	75 %	0 %	0 %	25 %	29611507
137	NC_004703	CGGA	2	8	7296	7303	25 %	0 %	50 %	25 %	29611507
138	NC_004703	ATG	2	6	7368	7373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611507
139	NC_004703	TATGA	2	10	7417	7426	40 %	40 %	20 %	0 %	29611507
140	NC_004703	TAT	3	9	7434	7442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29611508
141	NC_004703	GCCT	2	8	7450	7457	0 %	25 %	25 %	50 %	29611508
142	NC_004703	ATC	2	6	7465	7470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29611508
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146	NC_004703	TGG	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29611508
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166	NC_004703	TATT	2	8	8963	8970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_004703	AGT	2	6	8976	8981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_004703	TAT	2	6	8983	8988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_004703	GTT	2	6	9065	9070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_004703	GTG	2	6	9252	9257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29611509
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175	NC_004703	TAT	2	6	9493	9498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29611510
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256	NC_004703	AG	3	6	14458	14463	50 %	0 %	50 %	0 %	29611515
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259	NC_004703	AGA	2	6	14632	14637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29611515
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262	NC_004703	CAGGA	2	10	14745	14754	40 %	0 %	40 %	20 %	29611515
263	NC_004703	TCCG	2	8	14772	14779	0 %	25 %	25 %	50 %	29611515
264	NC_004703	GGAC	2	8	14825	14832	25 %	0 %	50 %	25 %	29611515
265	NC_004703	TA	3	6	14840	14845	50 %	50 %	0 %	0 %	29611515
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269	NC_004703	GACG	2	8	14927	14934	25 %	0 %	50 %	25 %	29611515
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272	NC_004703	GCCT	2	8	15117	15124	0 %	25 %	25 %	50 %	29611516
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401	NC_004703	T	8	8	22064	22071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_004703	AC	16	32	22076	22107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
403	NC_004703	GT	4	8	22110	22117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
404	NC_004703	CTTT	2	8	22154	22161	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
405	NC_004703	T	6	6	22159	22164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
406	NC_004703	AT	3	6	22217	22222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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408	NC_004703	AGA	2	6	22281	22286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
409	NC_004703	GCC	2	6	22290	22295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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414	NC_004703	TGG	2	6	22509	22514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29611527
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443	NC_004703	TATT	2	8	24339	24346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_004703	TG	3	6	26955	26960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
492	NC_004703	TAAA	2	8	26964	26971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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